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LINEAMIENTO ESTANDARIZADO PARA LA VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA Y POR LABORATORIO DE LA ENFERMEDAD RESPIRATORIA VIRAL. ABRIL DE 2020 Secretaría de Salud Subsecretaría de Prevención y Promoción de la Salud Dirección General de Epidemiología www.gob.mx/salud Se autoriza la reproducción parcial o total del contenido de este documento, siempre y cuando se cite la fuente. Hecho en México

DIRECTORIO

SECRETARÍA DE SALUD

DR. JORGE ALCOCER VARELA

SECRETARIO DE SALUD DRA. ASSA EBBA CHRISTINA LAURELL SUBSECRETARIA DE INTEGRACIÓN Y DESARROLLO DEL SECTOR SALUD DR. HUGO LÓPEZ-GATELL RAMÍREZ SUBSECRETARIO DE PREVENCIÓN Y PROMOCIÓN DE LA SALUD DR. PEDRO FLORES JIMÉNEZ TITULAR DE LA UNIDAD DE ADMINISTRACIÓN Y FINANZAS

DIRECCIÓN GENERAL DE EPIDEMIOLOGÍA

DR. JOSÉ LUIS ALOMÍA ZEGARRA

DIRECTOR GENERAL DE EPIDEMIOLOGÍA DR. CHRISTIAN ARTURO ZARAGOZA JIMÉNEZ DIRECTOR DE INFORMACIÓN EPIDEMIOLÓGICA DRA. ANA LUCÍA DE LA GARZA BARROSO DIRECTORA DE INVESTIGACIÓN OPERATIVA EPIDEMIOLÓGICA DRA. SANTA ELIZABETH CEBALLOS LICEAGA SUBDIRECTORA DE SISTEMAS ESPECIALES DE VIGILANCIA EPIDE- MIOLÓGICA DE ENFERMEDADES TRANSMISIBLES DRA. GABRIELA DEL CARMEN NUCAMENDI CERVANTES DIRECTORA DE VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA DE ENFERMEDADES NO TRANSMISIBLES MGS. LUCÍA HERNÁNDEZ RIVAS DIRECTORA DE SERVICIOS Y APOYO TÉCNICO BIOL. IRMA LÓPEZ MARTÍNEZ DIRECTORA DE DIAGNÓSTICO Y REFERENCIA

REPRESENTANTES DE LOS TITULARES EN EL GTI DEL

CONAVE

DRA. GABRIELA DEL CARMEN NUCAMENDI CERVANTES

DIRECTORA DE VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA DE ENFERMEDADES NO TRANSMISIBLES DIRECCIÓN GENERAL DE EPIDEMIOLOGÍA DR. CHRISTIAN ARTURO ZARAGOZA JIMÉNEZ DIRECTOR DE INFORMACIÓN EPIDEMIOLÓGICA

DIRECCIÓN GENERAL DE EPIDEMIOLOGÍA

DRA. ANA LUCIA DE LA GARZA BARROSO

DIRECTORA DE INVESTIGACIÓN OPERATIVA EPIDEMIOLÓGICA DIRECCIÓN GENERAL DE EPIDEMIOLOGÍA DRA. SANTA ELIZABETH CEBALLOS LICEAGA SUBDIRECTORA DE SISTEMAS ESPECIALES DE VIGILANCIA EPIDE- MIOLÓGICA DE ENFERMEDADES TRANSMISIBLES BIÓL. IRMA LÓPEZ MARTÍNEZ DIRECTORA DE DIAGNÓSTICO Y REFERENCIA INDRE M. EN G. S. LUCÍA HERNÁNDEZ RIVAS DIRECTORA DE SERVICIOS Y APOYO TÉCNICO INDRE DRA. ADRIANA STANFORD CAMARGO DIRECTORA DE EVIDENCIA EN SALUD DIRECCIÓN GENERAL DE PROMOCIÓN DE LA SALUD DR. ALEJANDRO LÓPEZ SÁMANO DIRECTOR DE URGENCIAS EPIDEMIOLÓGICAS Y DESASTRES CENTRO NACIONAL DE PROGRAMAS PREVENTIVOS Y CONTROL DE ENFERMEDADES DRA. NATALIA SORIANO CASTRO SUBDIRECTORA DE PARTICIPACIÓN SOCIAL DIRECCIÓN GENERAL DE PROMOCIÓN DE LA SALUD ING. JOSÉ HÉCTOR PAREDES MARTÍNEZ SUBDIRECTOR DE NOTIFICACIÓN Y REGISTROS EPIDEMIOLÓGICOS DIRECCIÓN GENERAL DE EPIDEMIOLOGÍA DRA. MARGOT GONZÁLEZ LEÓN JEFA DE LA DIVISIÓN DE VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA DE ENFERMEDADES TRANSMISIBLES IMSS DR. JOSÉ MISAEL HERNÁNDEZ CARRILLO JEFE DE LA OFICINA DE VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA IMSS-BIENESTAR

DR. OSCAR FLORES MUNGUÍA

JEFE DEL DEPTO. DE VIGILANCIA Y CONTROL EPIDEMIOLÓGICO ISSSTE CAP. SEGUNDO DE SANIDAD LUIS BERNARDO ROJAS GÓMEZ ENCARDO DE LA SUBSECCIÓN DE EPIDEMIOLOGÍA SEDENA TTE. DE FRAGATA S.S.N. M. EPIDEMIÓLOGO VÍCTOR GÓMEZ BOCANEGRA JEFE DEL DEPTO. DE EPIDEMIOLOGÍA DIRECCIÓN GENERAL ADJUNTA DE SANIDAD NAVAL SEMAR DR. HILARIO A. MARTÍNEZ ARREDONDO GERENTE DE PREVENCIÓN MÉDICA PEMEX DRA. PERLA RÍOS VILLALBA ESPECIALISTA EN SALUD PÚBLICA Y MEDICINA PREVENTIVA PEMEX DR. LUIS FELIPE ORTIZ GÓMEZ REPRESENTANTE DE LA DIRECCIÓN GENERAL DE REHABILITACIÓN SISTEMA NACIONAL PARA EL DESARROLLO INTEGRAL DE LA FAMILIA (SNDIF)

PROCEDIMIENTO DE ATENCIÓN INICIAL DE CASO SOSPECHOSO

DE ENFERMEDAD RESPIRATORIA VIRAL EN PUNTOS DE

ENTRADA INTERNACIONALES ............................................................................................ 42

ACTIVIDADES DE SANIDAD INTERNACIONAL ........................................................ 43

ACTIVIDADES ANTE UN CASO SOSPECHOSO DE ENFERMEDAD

RESPIRATORIA VIRAL ................................................................................................................. 44

IDENTIFICACIÓN DE CASOS SOSPECHOSOS DE ENFERMEDAD

RESPIRATORIA VIRAL EN AEROPUERTO, PUERTOS O PUNTOS

DE ENTRADA TERRESTRE ........................................................................................................ 45

PROCEDIMIENTOS PARA REPATRIACIÓN DE CONNACIONALES ANTE

COVID-19 ................................................................................................................................................ 48

APOYO DE OTRAS INSTANCIAS A LA VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA ....... 54

DIFUSIÓN DE LA INFORMACIÓN ............................................................................................. 54

REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS .............................................................................................. 55

ANEXOS .......................................................................................................................................................... 59

LINEAMIENTO ESTANDARIZADO PARA LA VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA Y POR LABORATORIO DE LA ENFERMEDAD RESPIRATORIA VIRAL. ABRIL DE 2020

INTRODUCCIÓN

En diciembre de 2019, se presentó en Wuhan, provincia de Hubei, de la República Popular China un brote de neumonía de causa desconocida. Lo anterior derivó en una investigación por el país de tal forma que las au- toridades de salud de la ciudad de Wuhan, informaron a la Organización Mundial de la Salud (OMS) la presencia de un conglomerado de 27 casos de Síndrome Respiratorio Agudo de etiología desconocida, establecien- do un posible vínculo con el mercado mayorista de mariscos de Huanan, el cual además vende animales vivos. (1) Lo anterior llevó a que científicos chinos aislaran una nueva cepa de coronavirus y realizaran la secuenciación genética, la cual se puso a dis- posición de la OMS facilitando a los laboratorios de diferentes países la producción de pruebas diagnósticas de PCR específicas para detectar la nueva infección. El virus aislado pertenece a los Betacoronavirus del gru- po 2B con al menos un 70% de similitud en la secuencia genética con el SARS-CoV, el cual se nombró por la OMS como 2019-nCoV. (2) El 30 de enero del 2020 con más de 9,700 casos confirmados de 2019- nCoV en la República Popular China y 106 casos confirmados en otros 19 países, el Director General de la Organización Mundial de la Salud (OMS), declaró el brote como una Emergencia de Salud Pública de Importancia Internacional (ESPII), aceptando la recomendación del Comité de Emer- gencia del Reglamento Sanitario Internacional (RSI). Siguiendo las mejo- res prácticas de la OMS para nombrar a las nuevas enfermedades infec- ciosas humanas, en colaboración y consulta con la Organización Mundial de Sanidad Animal (OIE) y la Organización de las Naciones Unidas para la Agricultura y la Alimentación (FAO), la OMS ha denominado la enferme- dad como COVID-19, abreviatura de “Enfermedad por coronavirus 2019” por sus siglas en inglés. El Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV), autoridad global para la designación de nombres a los virus, ha denominado a este como SARS-CoV-2. La información clínica sobre los casos confirmados de COVID-19 re- portados hasta ahora sugiere un curso de enfermedad diferente que el observado en casos de SARS-CoV y MERS-CoV. Sin embargo, con inves- tigaciones aún en curso, es difícil evaluar si hay grupos de población con mayor riesgo de enfermedad grave. (1,3)^ La información preliminar sugiere que los adultos mayores y las personas con afectación de la salud subya- centes pueden tener un mayor riesgo de presentar enfermedad grave por este virus. (4)

LINEAMIENTO ESTANDARIZADO PARA LA VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA Y POR LABORATORIO DE LA ENFERMEDAD RESPIRATORIA VIRAL. ABRIL DE 2020

Los coronavirus son virus ARN de cadena positiva que pertenecen al orden Nidovirales. Cuentan con una superficie característica, los virio- nes tienen una apariencia de corona bajo el microscopio electrónico, ra- zón por la cual llevan el nombre 'corona'. De la familia Coronaviridae y la subfamilia Orthocoronavirinae. Se clasifican además en cuatro géneros de coronavirus (CoV): Alfa, Beta, Delta y Virus gammacorona. El género Betacoronavirus se separa adicionalmente en cinco subgéneros ( Embe- covirus, Hibecovirus, Merbecovirus, Nobecovirus y Sarbecovirus ). (5-7) Los coronavirus se identificaron a mediados de los años 60 y se sabe que infectan a los humanos y a una variedad de animales (incluyendo aves y mamíferos). Las células epiteliales en el tracto respiratorio y gas- trointestinal son las células objetivo primarias, por lo que la eliminación viral es a través de estos sistemas y la transmisión puede ocurrir en dife- rentes rutas: fómites, aire o fecal-oral. (1) Hasta el 2018, se tenían identificados siete coronavirus capaces de infectar a los humanos, siendo los coronavirus humanos comunes: Be- tacoronavirus , HCoV-OC43 y HCoV-HKU1; así como el Alfacoronavirus HCoV-229E que causan enfermedades leves a moderadas de las vías respiratorias superiores, pero también graves infecciones del tracto res- piratorio en los grupos de edad más jóvenes y de mayor edad; mientras que Alfacoronavirus HCoV-NL63 se considera una causa importante de (pseudo) crup y bronquiolitis en niños. (5-10) Las infecciones en humanos con coronavirus comunes raramente causan enfermedad grave, como síndrome respiratorio agudo severo a excepción de MERS-CoV y SARS-CoV, los cuales han demostrado una alta tasa de letalidad en brotes (9.6% y 34.4% respectivamente). (11)

ANTECEDENTES

DIRECCIÓN GENERAL DE EPIDEMIOLOGÍA

SITUACIÓN EPIDEMIOLÓGICA

El 31 de diciembre de 2019, la Comisión Municipal de Salud de Wuhan en la ciudad de Wuhan, provincia de Hubei, de la República Popular Chi- na, informó de un grupo de 27 casos de neumonía de etiología desco- nocida, incluidos siete casos graves, todos con el antecedente de haber visitado el mercado mayorista de mariscos “Huanan”. Los casos presen- taron características clínicas comunes como fiebre, disnea e infiltrados pulmonares bilaterales en radiografías de tórax. Las autoridades pusieron todos los casos bajo aislamiento, se realizaron estudio de contactos, y se aplicaron medidas de higiene y saneamiento ambiental en el mercado, que finalmente se cerró al público el 1° de enero de 2020. Las investiga- ciones preliminares sugirieron un diagnóstico de neumonía viral. (12) Para el 5 de enero de 2020, se notificaron 32 casos adicionales de neu- monía de etiología desconocida en Wuhan, República Popular China con fechas de inicio de síntomas entre el 12 y 29 de diciembre de 2019, au- mentando el número total de casos de neumonía notificados de etio- logía desconocida a 59. Las investigaciones de laboratorio descartaron como agentes causales a los virus de influenza estacional y aviar, adeno- virus, SARS-CoV y MERS-CoV. En ese momento, las autoridades chinas informaron que no existía evidencia de transmisión de persona a persona y que no había casos entre trabajadores de la salud. (12) El Centro de Control de Enfermedades de la República Popular China, informó el 9 de enero de 2020, que se identificó un nuevo coronavirus como agente causal para 15 de los 59 casos de neumonía. El 10 de enero de 2020, investigadores del Centro Clínico y la Escuela de Salud Pública de Shanghái, en colaboración con el Hospital Central de Wuhan, Universi- dad de Ciencia y Tecnología de Huazhong, Centro de Wuhan para el Con- trol y Prevención de Enfermedades, el Instituto Nacional para el Control y Prevención de Enfermedades Transmisibles de la República Popular China, el Centro Chino para el Control de Enfermedades y la Universidad de Sidney, Australia, llevaron a cabo la secuenciación genética del virus. El análisis preliminar mostró una nueva cepa de coronavirus relacionado con el SARS-CoV difiriendo del genoma central del coronavirus de mur- ciélago conocido. El 12 de enero de 2020, la República Popular China da a conocer la secuencia genética del virus 2019- nCoV a los países para el desarrollo de pruebas diagnósticas. (13-15) El 13 de enero, el Ministerio de Salud Pública de Tailandia reportó el primer caso importado de enfermedad por 2019-nCoV confirmado por laboratorio, proveniente de la ciudad de Wuhan, provincia de Hubei, Re- pública Popular China. Para el 15 de enero, el Ministerio de Salud, Trabajo

DIRECCIÓN GENERAL DE EPIDEMIOLOGÍA Los presentes lineamientos se sustentan normativamente en lo esta- blecido en los artículos 3°, fracción XVII, 134 fracción XIV, 136 fracción II, 137, 138 y 142 de la Ley General de Salud y apartados 6.5, 6.5.1 y 6.5.2 de la Nor- ma Oficial Mexicana NOM-017-SSA-2-2012 para la vigilancia epidemioló- gica, acuerdo secretarial 130, toda vez que las Enfermedades Respirato- rias Virales implican un riesgo a la salud de la población. Actualmente la enfermedad por COVID-19 es considerada como una enfermedad emer- gente con riesgo alto de introducción al territorio mexicano. Asimismo, se sustenta en el Reglamento Sanitario Internacional (RSI 2005) con los artículos 2, 3, 6, 19, 23, 24, 30, 31 y 43. El incumplimiento de las acciones de vigilancia epidemiológica descri- tas en el presente lineamiento será motivo de reporte a las áreas adminis- trativas correspondientes de la Secretaría de Salud y, en caso de persis- tencia, a la instancia jurídica de su competencia.

MARCO LEGAL

LINEAMIENTO ESTANDARIZADO PARA LA VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA Y POR LABORATORIO DE LA ENFERMEDAD RESPIRATORIA VIRAL. ABRIL DE 2020

Establecer el lineamiento específico para la vigilancia epidemiológica y por laboratorio de la Enfermedad Respiratoria Viral, dentro del Sistema Nacional de Salud, que permita la detección de casos y riesgos para ge- nerar información epidemiológica de calidad, que oriente a la toma de decisiones para la implementación de medidas eficaces de prevención y control apropiadas para reducir los potenciales daños a la salud de la población.

Objetivos Específicos

1. Describir los procedimientos específicos para la vigilancia epide- miológica de Enfermedad Respiratoria Viral, que orienten las accio- nes en salud pública en el territorio nacional.
2. Establecer los procedimientos para la toma, manejo, envío y pro- cesamiento de las muestras de casos sospechosos de enfermedad respiratoria viral.
3. Realizar el monitoreo, alertamiento y difusión con respecto al com- portamiento epidemiológico de la enfermedad respiratoria vial, a nivel internacional y en nuestro país, para orientar las medidas de prevención y control.

OBJETIVO GENERAL

LINEAMIENTO ESTANDARIZADO PARA LA VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA Y POR LABORATORIO DE LA ENFERMEDAD RESPIRATORIA VIRAL. ABRIL DE 2020

Caso sospechoso: Persona de cualquier edad que en los últimos 7 días haya presentado al menos dos de los siguientes signos y síntomas: tos, fiebre o cefalea* Acompañados de al menos uno de los siguientes signos o síntomas:

• Disnea (dato de gravedad)
• Artralgias
• Mialgias
• Odinofagia/Ardor faríngeo
• Rinorrea
• Conjuntivitis
• Dolor torácico Caso de Infección Respiratoria Aguda Grave: Toda persona que cumpla con la definición de caso sospechoso de En- fermedad Respiratoria Leve y además presente dificultad para respirar y esté hospitalizado. Caso confirmado: Persona que cumpla con la definición operacional de caso sospechoso y que cuente con diagnóstico confirmado por laboratorio de la Red Na- cional de Laboratorios de Salud Pública reconocidos por el InDRE** *En menores de cinco años de edad, la irritabilidad puede sustituir a la cefalea. ** Se publicará la lista actualizada de laboratorios validada por el InDRE y se difundirá cada actualización de la misma por CONAVE. La vigilancia epidemiológica de COVID-19 cambiará de una vigilancia nacional a vigilancia centinela; la vigilancia nacional únicamente se reali- zara para los casos graves (Infección Respiratoria Aguda Grave). La vigilancia centinela se realizará en las 475 unidades activas actual- mente del SISVEFLU, el cual cambiará su nombre a SISVER.

DEFINICIONES OPERACIONALES PARA

LA VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA DE

ENFERMEDAD RESPIRATORIA VIRAL

DIRECCIÓN GENERAL DE EPIDEMIOLOGÍA Las denominadas USMI, cambiaran de nombre a USMER y el mues- treo se deberá de llevar a cabo de la siguiente manera: Se tomará el siguiente porcentaje de muestreo para la vigilancia epi- demiológica de la enfermedad respiratoria viral

• Casos sospechosos con síntomas leves: 10% (ambulatorios)***
• Casos sospechosos con sintomatología grave: 100% (dificultad respi- ratoria).
• Tomar el 100% de muestras a pacientes graves que cumplan defi- nición de Infección Respiratoria Aguda Grave (IRAG), de todas las unidades médicas del país. *****Las instituciones que cuenten con más recursos podrán utilizar- los para muestrear mayor porcentaje de pacientes ambulatorios.** Nota aclaratoria: Las definiciones operacionales están sujetas a cambios y serán actualizadas de acuerdo con la disponibilidad de información adicional únicamente por el Comité Nacional para la Vi- gilancia Epidemiológica (CONAVE).
• Todas las unidades USMER y no USMER capturarán en la platafor- ma del SISVER; las unidades no USMER, recibirán claves de acce- so a SISVER; las cuales solo deberán de capturar los casos graves para priorizar el recurso, 100% de casos graves capturados, si entidad cuenta con el recurso, podrá muestrear a los casos leves y registrar- los en plataforma SISVER/SINOLAVE.
• Los LESP/LAVE, deberán capturar el resultado en la plataforma del SISVER.
• Todas las unidades que conforman el Sistema Nacional de Salud de- berán de realizar la notificación a la Notificación Convencional (SUI- VE) del 100% de los casos que cumplan con definición operacional de caso de enfermedad respiratoria viral y únicamente llenar el es- tudio epidemiológico de caso para pacientes graves.
• Se llevará a cabo la vigilancia epidemiológica de la enfermedad respiratoria viral es espacios públicos cerrados (albergues, refugios, centros de detención, cáceles, hospitales, etc.), con la finalidad de llevar a cabo la detección de brotes
• En las USMER, todas las defunciones sospechosas y confirmadas de enfermedad respiratoria viral, deberán ingresarse a la plataforma del SISVER.
• En las unidades no USMER, se deberán notificar todas las defuncio- nes por correo electrónico al responsable del SEED, y al responsable del SISVEFLU, de la Dirección General de Epidemiología, adjuntado: a) certificado de defunción, b) cédula de SISVER, c) prueba positiva de laboratorio, d) resumen clínico y e) anexo 8 (solo si se tiene de forma inmediata).