Docsity
Docsity

Prepara tus exámenes
Prepara tus exámenes

Prepara tus exámenes y mejora tus resultados gracias a la gran cantidad de recursos disponibles en Docsity


Consigue puntos base para descargar
Consigue puntos base para descargar

Gana puntos ayudando a otros estudiantes o consíguelos activando un Plan Premium


Orientación Universidad
Orientación Universidad

Lectura semana 11- Biología, Esquemas y mapas conceptuales de Biología Celular y Molecular

Material de año 2025 ciclo 2 medicina

Tipo: Esquemas y mapas conceptuales

2024/2025

Subido el 18/06/2025

maria-vidaurre-purizaca
maria-vidaurre-purizaca 🇵🇪

3 documentos

1 / 5

Toggle sidebar

Esta página no es visible en la vista previa

¡No te pierdas las partes importantes!

bg1
Síntesis y plegado de proteínas 1
Síntesis y plegado de proteínas
Traducción para uso interno USMP: C. Amanzo
Cualquiera que sea su destino final, el citoplasma, las membranas o las proteínas espaciales extracelulares se sintetizan
en el citoplasma de las células procarióticas y eucarióticas. Las únicas excepciones son las proteínas codificadas por
genes en mitocondrias y cloroplastos, que se sintetizan en esos orgánulos.
La síntesis bioquímica de las proteínas se llama traducción,
ya que el proceso traduce secuencias de nucleótidos en un ARN mensajero (mRNA) en la secuencia de aminoácidos en
una cadena de polipéptidos (Fig. 12.1). La traducción del ARNm requiere las acciones concertadas de pequeños ARNs
de transferencia (tRNAs) ligados a aminoácidos, ribosomas (complejos de ARN y proteínas) y muchas proteínas solubles.
La unión e hidrólisis del trifosfato de guanosina (GTP) regula varias proteínas que orquestan las interacciones de estos
componentes. En última instancia, las moléculas de ARN en el ribosoma catalizan la formación de los enlaces
peptídicos. Algunos polipéptidos recién sintetizados se pliegan espontáneamente en su estructura nativa en el
ambiente celular, pero muchos requieren ayuda de proteínas llamadas chaperonas.
Todos los organismos contemporáneos comparten un aparato de traducción común, por lo que el mecanismo de
formación de enlaces de péptido debe ser preexistente al ancestro común hace aproximadamente 3.500 millones de
años. Para el tiempo del antepasado común, muchas características regulatorias relativamente complicadas estaban en
su lugar y fueron heredadas a través del árbol filogenético.
FIGURA 12.1 RESUMEN DEL CICLO DE TRADUCCIÓN QUE MUESTRA SEIS RIBOSOMAS EN UN SOLO ARNm.
1. Iniciación. El iniciador tRNAMet, el mRNA y los factores solubles accesorios se ensamblan en la subunidad pequeña, que luego se une con una
subunidad grande. Met es el código de tres letras para la metionina.
2. Alargamiento. La cadena de polipéptidos se sintetiza, en el orden especificado por el mRNA, en pasos secuenciales mediante el reclutamiento
de nuevos aa-tRNAs que coinciden con la secuencia de codificación del mRNA, la formación de enlaces de péptidos y la disociación del tRNA
libre.
3. Terminación. Los factores de liberación reconocen el codón de parada (amarillo) y terminan la traducción. El ribosoma libera el polipéptido para
plegar el citoplasma.
4. Reciclaje de Subunidades. Las subunidades ribosómicas se disocian y están disponibles para otra ronda de traducción. aa-tRNA, Aminoacil-tRNA;
AUG, codón de iniciación; GTPasa, guanosina trifosfatasa; tRNA, ARN de transferencia.
Maquinaria de síntesis de proteínas
RNA mensajero
Los mRNAs tienen tres partes: los nucleótidos en el extremo 5´ proporcionan sitios de unión para las proteínas que
inician la síntesis de polipéptidos; los nucleótidos en el centro especifican la secuencia de aminoácidos en el
polipéptido; y los nucleótidos en el extremo 3´ regulan la estabilidad del mRNA (Fig. 1.1). Dentro de la región que
codifica las proteínas, tripletes de tres nucleótidos sucesivos, llamado s codones, especifican la secuencia de
aminoácidos. El código genético que relaciona los tripletes de nucleótidos con los aminoácidos es, con unas pocas
excepciones menores, universal. Entre uno y seis diferentes codones de tripletes codifican cada aminoácido (Fig. 12.2).
Un codón de iniciación (AUG) específica la metionina, que inicia todas las cadenas de polipéptidos, pero que
pf3
pf4
pf5

Vista previa parcial del texto

¡Descarga Lectura semana 11- Biología y más Esquemas y mapas conceptuales en PDF de Biología Celular y Molecular solo en Docsity!

Síntesis y plegado de proteínas

Traducción para uso interno USMP: C. Amanzo

Cualquiera que sea su destino final, el citoplasma, las membranas o las proteínas espaciales extracelulares se sintetizan en el citoplasma de las células procarióticas y eucarióticas. Las únicas excepciones son las proteínas codificadas por genes en mitocondrias y cloroplastos, que se sintetizan en esos orgánulos. La síntesis bioquímica de las proteínas se llama traducción, ya que el proceso traduce secuencias de nucleótidos en un ARN mensajero (mRNA) en la secuencia de aminoácidos en una cadena de polipéptidos (Fig. 12.1). La traducción del ARNm requiere las acciones concertadas de pequeños ARNs de transferencia (tRNAs) ligados a aminoácidos, ribosomas (complejos de ARN y proteínas) y muchas proteínas solubles. La unión e hidrólisis del trifosfato de guanosina (GTP) regula varias proteínas que orquestan las interacciones de estos componentes. En última instancia, las moléculas de ARN en el ribosoma catalizan la formación de los enlaces peptídicos. Algunos polipéptidos recién sintetizados se pliegan espontáneamente en su estructura nativa en el ambiente celular, pero muchos requieren ayuda de proteínas llamadas chaperonas. Todos los organismos contemporáneos comparten un aparato de traducción común, por lo que el mecanismo de formación de enlaces de péptido debe ser preexistente al ancestro común hace aproximadamente 3.500 millones de años. Para el tiempo del antepasado común, muchas características regulatorias relativamente complicadas estaban en su lugar y fueron heredadas a través del árbol filogenético.

FIGURA 12.1 RESUMEN DEL CICLO DE TRADUCCIÓN QUE MUESTRA SEIS RIBOSOMAS EN UN SOLO ARNm.

  1. Iniciación. El iniciador tRNAMet, el mRNA y los factores solubles accesorios se ensamblan en la subunidad pequeña, que luego se une con una subunidad grande. Met es el código de tres letras para la metionina.
  2. Alargamiento. La cadena de polipéptidos se sintetiza, en el orden especificado por el mRNA, en pasos secuenciales mediante el reclutamiento de nuevos aa-tRNAs que coinciden con la secuencia de codificación del mRNA, la formación de enlaces de péptidos y la disociación del tRNA libre.
  3. Terminación. Los factores de liberación reconocen el codón de parada (amarillo) y terminan la traducción. El ribosoma libera el polipéptido para plegar el citoplasma.
  4. Reciclaje de Subunidades. Las subunidades ribosómicas se disocian y están disponibles para otra ronda de traducción. aa-tRNA, Aminoacil-tRNA; AUG, codón de iniciación; GTPasa, guanosina trifosfatasa; tRNA, ARN de transferencia.

Maquinaria de síntesis de proteínas RNA mensajero Los mRNAs tienen tres partes: los nucleótidos en el extremo 5´ proporcionan sitios de unión para las proteínas que inician la síntesis de polipéptidos; los nucleótidos en el centro especifican la secuencia de aminoácidos en el polipéptido; y los nucleótidos en el extremo 3´ regulan la estabilidad del mRNA (Fig. 1.1). Dentro de la región que codifica las proteínas, tripletes de tres nucleótidos sucesivos, llamados codones, especifican la secuencia de aminoácidos. El código genético que relaciona los tripletes de nucleótidos con los aminoácidos es, con unas pocas excepciones menores, universal. Entre uno y seis diferentes codones de tripletes codifican cada aminoácido (Fig. 12.2). Un codón de iniciación (AUG) específica la metionina, que inicia todas las cadenas de polipéptidos, pero que

posteriormente puede ser eliminada. Además, cualquiera de los tres codones de terminación (UAA, UGA, UAG) detiene la síntesis peptídica. Los mRNAs eucarióticos y bacterianos difieren de tres maneras. Primero, los mRNAs eucarióticos codifican una proteína, mientras que los mRNAs bacterianos generalmente codifican más de una proteína. En segundo lugar, la mayoría de los mRNAs eucarióticos (y virus eucarióticos) están cubiertos por un residuo invertido de 7-metilguanosina unido al extremo 5´ del mRNA por un enlace de 5´-trifosfato-5´ (ver Fig. 11.2 y Fig. 12.3). Este capuchón de 5´ es estable a lo largo de la vida del mRNA. Proporciona un sitio de unión para las proteínas y protege el extremo 5´ contra el ataque de las nucleasas. Tercero, la mayoría de los mRNAs metazoos requieren procesamiento para eliminar los intrones (ver Fig. 11.4). La mayoría de los ARNm eucarióticos tienen una cola 3´ de 50 a 200 residuos de adenina añadidos post- transcripcionalmente al extremo 3´ (ver Fig. 11.3). Esta cola de poli (A) une una proteína que promueve la exportación desde el núcleo y protege al ARNm de la degradación del citoplasma. Las colas 3´ poli (A) son más cortas o están ausentes en los mRNAs bacterianos. Muchos mRNAs de cadena simple tienen una estructura secundaria de doble cadena (ver Fig. 3.19) que debe ser interrumpida durante la traducción para permitir la lectura de cada codón.

FIGURA 12.2 EL CÓDIGO GENÉTICO. La ubicación del nucleótido en la primera, segunda y tercera posición definen el aminoácido determinado por el código.

FIGURA 12.3 ESTRUCTURA DEL CAP DE mRNA. Los mRNAs procarióticos (ARNs mensajeros) terminan con un trifosfato de 5´. El capuchón 5´ de los ARNm eucarióticos consiste en un residuo de 7- metilguanosina (m7G) ligado al ARNm por tres fosfatos. La proteína eIF-4E se une al cap y protege contra la degradación de las nucleasas.

RNA de transferencia Los tRNAs son adaptadores que suministran aminoácidos a la maquinaria de traducción combinando codones de mRNA con sus correspondientes aminoácidos a medida que se incorporan a un polipéptido en crecimiento (Fig. 12.4). De uno

Aunque todos los ribosomas derivan de un antepasado común y tienen mecanismos de acción similares, sus estructuras han divergido. Los ribosomas mamíferos tienen RNAs más grandes y más proteínas que los procarióticos y los ribosomas mitocondriales. Los ARNs ribosómicos constituyen el núcleo estructural de cada subunidad ribosómica (Fig. 12.7). El rRNA 18S de la subunidad pequeña de los ribosomas mamíferos contiene aproximadamente 1900 nucleótidos, la mayoría de los cuales están plegados en hélices emparejadas con la base. La subunidad mayor de los ribosomas mamíferos incluye tres RNAs: un rRNA 28S que consiste en aproximadamente 5000 nucleótidos, un rRNA 5.8S de 156 nucleótidos y un rRNA 5S de 121 nucleótidos. Los rARNs se pliegan en muchas hélices emparejadas, como se predijo primero al comparar las secuencias de los rRNAs de muchas especies diferentes (Fig. 12.6). Estas hélices y sus bucles intermedios se embalan para formar una estructura compacta. Aunque los rRNAs procarióticos difieren en tamaño y secuencia de los rRNAs eucarióticos, se pliegan de manera similar. Se han conservado muchas características de los rRNAs durante la evolución, incluyendo las superficies donde interactúan las subunidades, los sitios para la unión del tRNA, el mRNA y los cofactores de proteínas, y los nucleótidos involucrados en la formación de enlaces de péptidos. La mayoría de las proteínas ribosómicas se asocian con la superficie del núcleo del rRNA, aunque varias de ellas extienden las hebras del péptido al núcleo (Fig. 12.7). Las proteínas ribosómicas son generalmente pequeñas (10 a 30 kD) y básicas. Con una excepción, los ribosomas tienen sólo una copia de cada proteína. La decodificación de los ARNm y la síntesis de polipéptidos tiene lugar en la cavidad entre las subunidades. Las superficies de esta cavidad generalmente están libres de proteínas, por lo que (afortunadamente) los rARN -no las proteínas- son en gran medida responsables de la unión con el mRNA, la unión con el tRNA y la catálisis de la formación de enlaces peptídicos. Los tRNAs se mueven secuencialmente a través de tres sitios compartidos por las dos subunidades: el sitio A (aa-tRNA), el sitio P (para peptidil-tRNA) y el sitio E (para la salida). La creciente cadena de polipéptidos sale por un túnel que pasa a través del centro del ARN de la subunidad mayor. La síntesis y montaje de un ribosoma de levadura requiere la participación de las tres polimerasas de ARN, 75 pequeños ARNs nucleolares (snoRNAs) y más de 200 factores proteicos, además de las 80 proteínas ribosómicas y 4 rRNAs presentes en los ribosomas maduros. Los RNAs precursores se dividen y modifican para formar los rRNAs (ver Fig. 11.10). Los factores de ensamblaje que consisten en los snoRNAs y numerosas proteínas orquestan el ensamblaje escalonado de los rRNAs y proteínas ribosómicas en las subunidades mayor y menor y guían su exportación del núcleo al citoplasma. Aunque los genes de muchas proteínas ribosómicas son esenciales para la viabilidad, las mutaciones en algunos pueden causar defectos notablemente específicos. Por ejemplo, a las personas con un solo gen funcional para la proteína ribosómica RPSA les falta el bazo, pero son normales. Las mutaciones en los genes para otras subunidades causan anemia y las mutaciones en los genes para ciertas proteínas de ensamblaje causan enfermedad hepática.

FIGURA 12.5 CARGA DE UN ARNt CON SU ÁCIDO AMINO CORRECTO. tRNA sintetasas de ARNt (mostrada esquemáticamente y como un modelo atómico que llena el espacio en púrpura) proporcionan una plataforma de acoplamiento para un aminoácido específico y su tRNA correspondiente (mostrado en naranja como modelo esquemático y como modelo de cinta atado a una sintetasa). El aminoácido se activa primero por reacción con el trifosfato de adenosina (ATP). El grupo carboxilo del aminoácido está acoplado al a-fosfato de adenosina monofosfato (AMP) con la liberación de pirofosfato. La sintetasa entonces transfiere el aminoácido del

aminoácido del aminoacil-AMP (aa-AMP) a un enlace de éster de alta energía con el 2´ (ilustrado aquí) o 3´ hidroxilo de la adenina en el extremo 3´ del tRNA. aa, Aminoacil; PPi, fosfato inorgánico.

FIGURA 12.6 COMPONENTES MOLECULARES DE LOS RIBOSOMAS. El ARN es de color gris claro en las subunidades menores y de color gris oscuro en las grandes subunidades. Las proteínas son de color. A, Estructura cristalina del ribosoma 70S de la bacteria termofílica Thermus thermophilus. B, estructura microscópica crioelectrónica del ribosoma 80S del páncreas de cerdo que sintetiza activamente la proteína. Las tres columnas muestran modelos que llenan el espacio (izquierda), inventarios de ARNs ribosomales (rRNAs) y proteínas (medio), y mapas de las estructuras secundarias de rRNAs procarióticos 16S y 18S para ilustrar sus similitudes a pesar de las secuencias divergentes.

FIGURA 12.7 ESTRUCTURA DEL RIBOSOMA MAMÍFERO. La estructura que tiene el ribosoma Thermus thermophilus porcino. El RNA se muestra en color gris claro para la subunidad menor y en color gris oscuro para la subunidad mayor, y las proteínas se muestran en una gama de colores. A, Vista lateral de un modelo que llena el espacio. B, Vista lateral seccionada de la subunidad grande mostrando el polipéptido elongante (como un zigzag negro) en el canal de salida a través del núcleo de la subunidad grande. C-E, modelos de llenado espacial desde diferentes puntos de vista. C, Vista inferior que muestra el poro del canal de salida. D, vista de la parte superior que muestra el sitio activo. E, Vista de la parte superior que muestra tres ARN de transferencia (naranja) unidos en el sitio activo. F, vista superior con diagramas de cinta de las proteínas sin ARN.

Factores proteicos solubles Muchas proteínas solubles circulan dentro y fuera de los ribosomas durante la síntesis de proteínas, aumentando la velocidad y/o la fidelidad de las reacciones que se producen allí. Las siguientes secciones resaltan la función o funciones de estos factores solubles.