ALFREDO OCHOA
ACOPLAMIENTO
MOLECULAR Y
METODOS
FARMACOFORICOS
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Exposicion sobre acoplamiento molecular, Diapositivas de Química Farmaceútica
En este archivo se describe el acoplamineto molecular referente a farmacos asi como sus innovaciones en el ambito del DOKING MOLECULAR
Tipo: Diapositivas
2019/2020
1 / 16
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ALFREDO OCHOA
ACOPLAMIENTO
MOLECULAR Y
METODOS
FARMACOFORICOS
DE
CONTENI
DOS
ACOPLAMIENTO MOLECULAR
Introduuccion a los modelos de acoplamiento molecular
ACOPLAMIENTO RIGIDO
Por modelo de Emil Fisher: La llave y cerradura
ACOPLAMIENTO FLEXIBLE
Descripcion de capacidades flexibles de la proteina.
MODELOS FARMACOFOROS
Innovacion de la investigacion de nuevos farmacos.
En esta aproximación se asume que ligando y proteína están rígidos durante su interacción.
RIGIDO
COVALEN
TE
FLEXIBLE
Este se deriva del modelo de ajuste inducido, considerando que la unión del ligando y la proteína se debe a una influencia directa y flexible entre si. Este es un método eficaz para evaluar las interacciones nucleofílicas y electrofílicas entre inhibidores covalentes de plomo y residuos de proteínas dianas ACOPLAMIENTO MOLECULAR
El modelo rigido de “la llave y la cerradura “fue propuesto por Emil Fisher, un quimico aleman galardonado al premio novel de quimica por el descubrimiento de barbital.
ACOPLAMIENTO
RIGIDO
Modelo Flexible o encaje inducido
Este modelo sugiere una interacción mas flexible y plástica entre la
enzima y su sustrato. La idea es que a medida que el sustrato se acerca
a la enzima, induce cambios de forma en ella, de manera de
“acomodarse” y asi establecer la relación especifica que caracteriza a
● (^) Leyes de Coulumb ● Leonnard Jones. ● (^) Van der Waals ● (^) Peso Molecular ● (^) Masa Exacta ROS INFORMA TICOS La simulación de reacciones moleculares se lleva acabo por un algoritmo que genera miles de diferentes combinaciones y cálculos matemáticos Este valor de puntuaje es el criterio de selección para la solución mas optima.
DESVENTAJA S 1- En prácticamente ningún caso el ligando se encuentra en su conformación más estable cuando interactúa con una proteína. 2- Hasta ahora no se ha desarrollado un algoritmo capaz de considerar en forma “natural” la flexibilidad y su influencia en el reconocimiento. 3- En pocos casos se considera la contribución del agua durante la unión proteína-ligando, debido a que aún es complicado modelar en forma rápida y precisa las moléculas del agua en forma explícita. 4-No hay información en el DataBank.
MODELOS FARMACOFO RICOS Este tipo de modelado permite identificar estructuras diversas, siempre y cuando se ajusten a los requerimientos necesarios, pueden usarse como criterios de orientación para refinar los resultados de un acoplamiento molecular. Para desarrollar un modelo farmacoforico se necesita subir al programa la mayor cantidad de información posible sobre el receptor e inhibidores conocidos, por lo que deberá ser acualizado constantemente. La eficacia de este método se valida mediante un análisis de