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Ejercicios diseño de primers para RT-PCR
𝑈𝑛𝑖𝑣𝑒𝑟𝑠𝑖𝑑𝑎𝑑 𝐴𝑢𝑡ó𝑛𝑜𝑚𝑎 𝑑𝑒 𝑀é𝑥𝑖𝑐𝑜 − 𝑈𝑛𝑖𝑑𝑎𝑑 𝐶𝑢𝑎𝑗𝑖𝑚𝑎𝑙𝑝𝑎 𝐿𝑖𝑐𝑒𝑛𝑐𝑖𝑎𝑡𝑢𝑟𝑎 𝐵𝑖𝑜𝑖𝑛𝑓𝑜𝑟𝑚𝑎𝑡𝑖𝑐𝑎 𝑒𝑛 𝐵𝑖𝑜𝑙𝑜𝑔 𝑀𝑜𝑙𝑒𝑐𝑢𝑙𝑎𝑟í𝑎 𝑀𝑜𝑙𝑒𝑐𝑢𝑙𝑎𝑟 𝐷𝑟𝑎. 𝐴𝑦𝑙𝑖𝑛 𝑑𝑒𝑙 𝑀𝑜𝑟𝑎𝑙𝑒𝑠
1. CCTCF
En general todos los primers entraban en los parámetros necesarios para poder elegirlo pero decidí escoger el primer #7 debido a que cuenta con una longitud no mayor a 25 bases, muestra un contenido de G y C entre el 40%-60%, terminación de G y C, un templado entre 55 C-65 C y por último una complementariedad en ambas cadenas con un valor cercano a 0 y evitando valores mayores a 4. Por lo que se pudo deducir que este sería el mejor primer para poder utilizar
2. JPX
En el caso del gen JPX decidí escoger el primer #7 debido a que cuenta con una longitud de
20 bases(que es lo ideal), muestra un contenido de G y C entre el 40%-60%, terminación de C(en una de las cadenas), un templado entre 55 C-65 C y por último una complementariedad en ambas cadenas con un valor cercano a 0 y evitando valores mayores a 4. Por lo que se pudo deducir que este sería el mejor primer para poder utilizar debido a que los demás primers se salían del rango de las características mencionadas anteriormente.
3. XIST
En el caso del gen XIST el primer #8 fue seleccionado como mejor primer debido a que cuenta con una longitud de 20 bases(que es lo ideal), muestra un contenido de C entre el 40%-60%, terminación de C (en una de las cadenas), un templado entre 55 C-65 C y por último una complementariedad en ambas cadenas con un valor cercano a 0 y evitando valores mayores a 3. Por lo que se pudo deducir que este sería el mejor primer para poder utilizar debido a que los demás primers se salían del rango de las características mencionadas anteriormente.
Diseño de oligos
1. CCTCF
